โรงเรียนเซนต์หลุยส์ ฉะเชิงเทรา ได้รับการยกย่องและประกาศเกียรติคุณ ในการมีบทบาทสนับสนุนเพื่อพัฒนาคุณภาพ การจัดการศึกษาของโรงเรียนเอกชน กิจกรรมการติดตามการนำผลการประเมินคุณภาพภายนอกไปใช้ในการพัฒนาคุณภาพการจัดการศึกษา และการจัดทำเล่มนวัตกรรมการศึกษา ของสำนักงานคณะกรรมการส่งเสริมการศึกษาเอกชน